צוות חילוץ נשלח למקום המסוכן ביותר עלי אדמות - מתקן מחקר נטוש על אי מסתורי, ששימש את פארק היורה המקורי, וכיום מאוכלס ביצורים המסוכנים ביותר שנותרו מאחור.

חמש שנים לאחר אירועי הסרט הקודם הוכח כי האקולוגיה של כדור הארץ אינה מתאימה לדינוזאורים. אלה ששרדו מתקיימים רק באזורים מבודדים בקרבת קו המשווה, בעלי אקלים דומה לזה שבו הם שגשגו בעבר. שלושה מהיצורים האדירים ביותר ביבשה, בים, ובאוויר, מחזיקים בגנום שלהם את המפתח לפיתוח תרופה מהפכנית שיכולה להציל חיים.

זוכת האוסקר ג’והנסון מגלמת את זורה בנט, מומחית למבצעי חילוץ, שתפקידה הוא להוביל צוות מיומן במשימה סודית להשגת החומר הגנטי החיוני. כאשר המבצע של זורה מתנגש עם משפחה אזרחית שטיול השייט שלה הסתיים באסון בעקבות מתקפה של דינוזאורים ימיים, הם מוצאים את עצמם לכודים באי האסור - אתר מחקר סודי לשעבר של פארק היורה. שם, בין מיני דינוזאורים שונים ומסוכנים, הם נתקלים בגילוי אפל ומטלטל שהוסתר מהעולם במשך עשורים.